Susunan kepengurusan SAF FKUI periode 2023-2028 adalah sebagai berikut:
Ketua : Dr. dr. Herqutanto, M.P.H., M.A.R.S
Sekretaris : Dr. dr. Tiara Aninditha, Sp.S.(K)
Komisi 1 Bidang Pendidikan
Ketua : Prof. dr. Diantha Soemantri, M.Med.Ed., Ph.D
Sekretaris : dr. Imelda Rosalyn Sianipar, M.Biomed., Ph.D
Komisi 2 Bidang Penelitian dan Inovasi
Ketua : Prof. Dr. rer. physiol. dr. Septelia Inawati Wanandi
Sekretaris : Dr. Desak Gede Budi Krisnamurti, S.Farm, Apt., M.Biomed
Komisi 3 Bidang Pengabdian Masyarakat dan Pelayanan Masyarakat
Ketua : Prof. Dr. dr. Chaidir Arif Mochtar, Sp.U.(K)
Sekretaris : Dr. dr. Virna Dwi Oktariana Asrory, Sp.M.(K)
Komisi 4 Bidang Sumber Daya Manusia dan Organisasi
Ketua : Dr. dr. Renindra Ananda Aman, Sp.BS.(K)
Sekretaris : Prof. Dr. Melva Louisa, S.Si., M.Biomed