Departemen Fisiologi dan Biofisika Kedokteran FKUI merupakan salah satu Departemen Fisiologi yang terkemuka di kawasan Indonesia, yang menyelenggarakan pendidikan, penelitian, dan pelayanan masyarakat dengan kualitas dan kuantitas tinggi, serta menganut nilai yang berbudaya, ilmiah, dan keterbukaan serta berorientasi kepada kepentingan masyarakat.
Departemen Fisiologi FKUI menyelenggarakan dan mengembangkan berbagai jenjang dan jenis pendidikan fisiologi yang bermutu dan bertaraf internasional sesuai dengan arah pengembangan FKUI. Departemen Fisiologi FKUI juga menyelenggarakan dan mengembangkan berbagai penelitian fisiologi yang berskala internasional, berorientasi pada evidance based medicine, serta menghasilkan produk penelitian yang bermanfaat bagi masyarakat, keilmuan, dan pendidikan.
Departemen Fisiologi FKUI senantiasa mengembangkan pelayanan masyarakat yang berbasis fisiologi secara tepat guna, dengan penerapan iptekdok dalam berbagai jenis pelayanannya, dan menyelenggarakan organisasi dan manajemen yang bermutu dengan peningkatan jaringan kemitraan yang didukung oleh fasilitas memadai untuk menuju optimalisasi kinerja serta kesejahteraan seluruh staf dan karyawan Departemen Fisiologi FKUI.