Visi Departemen Patologi Klinik FKUI adalah menjadi program studi yang terkemuka di tingkat nasional dan internasional yang melaksanakan fungsi pendidikan akademik profesional, penelitian, dan pelayanan kesehatan dengan mengembangkan sumber daya manusia yang memiliki sentuhan manusiawi dan berorientasi kepada kepentingan masyarakat.
Sebagai langkah untuk mewujudkan visi tersebut, Departemen Patologi Klinik FKUI menjalankan misi dengan menyelenggarakan program pendidikan dokter dan dokter spesialis I patologi klinik yang didukung pengembangan riset sehingga mampu melaksanakan pelayanan kesehatan jenjang kedua sesuai dengan standar profesi dan perkembangan ilmu pengetahuan dan teknologi kedokteran di bidang Patologi Klinik.
Menyelenggarakan program Pendidikan Dokter dan Dokter Spesialis I Patologi Klinik dengan mengembangkan organisasi dan manajemen yang berorientasi pada kualitas, otonomi, akuntabilitas dan akreditasi. Menghasilkan lulusan yang memiliki keterampilan yang lengkap di bidang Patologi Klinik dengan memasukkan prinsip pendidikan hospital-base teaching dalam proses pembelajaran dan peningkatan kemampuan psikomotor.
Membina jaringan kemitraan dengan berbagai rumah sakit pendidikan, rumah sakit pemerintah maupun swasta di Indonesia, serta ikut berperan dalam meningkatkan taraf kesehatan masyarakat Indonesia melalui lulusan yang bermutu, berwawasan kerakyatan, dan berjiwa sosial.
Departemen Patologi Klinik FKUI saat ini diketuai oleh dr. Dewi Wulandari, SpPK, MSc.